连云港公立三甲医院做试管婴儿的费用是不能用医保报销的。试管婴儿技术属于辅助生殖技术，其费用通常包括医疗费用、药品费用、手术费用等。而我国医保政策对于辅助生殖技术的报销政策尚未统一，连云港地区也并没有将试管婴儿纳入医保报销范围，所以这些医疗费用都需要自费。
连云港试管婴儿费用报销政策
在连云港做试管婴儿期间的费用并不能报销，如果是打算通过试管婴儿技术成功怀孕，治疗期间的各项花费均需要患者自行支付，连云港地区未将试管婴儿技术纳入到医保，主要原因有以下几点：
- 试管婴儿是现代助孕技术，并不属于是疾病范畴，因此做试管婴儿期间的所有花费暂不能通过医保和新农村合作医疗报销；
- 做试管婴儿的费用偏高，如果将试管费用纳入到医保中，这对国家资金消耗非常大，甚至可能会导致国库空虚。
目前而言，国内只有少部分省市将试管婴儿费用纳入到医保中了，虽然说连云港目前不能用医保报销，但是国内部分地区虽然未出台试管婴儿费用不能用医保报销， 但是有一些检查费用是可以用医保的，也是可以消费医保卡内余额的，并且有一部分失独家庭如果是选择做试管，还可以申请 给予的补助金，具体你需要询问当地的生育部门。